本底补偿是在线硅酸根分析仪所特有的一项功能。在仪表维护中可以将此项功能设为开或关。设置本底补偿功能的原因是：我们校准仪表所用的标准液是以零硅水为基础的，而在现实当中，根本就没有零硅水的存在，无论我们怎么努力，硅离子还是存在于水中，所以我们所做的标准除了添加的含量外还有水中原本就有的硅含量，即实际的硅离子浓度总比理论的硅离子浓度高，并且由于水中所含硅离子的浓度是一个未知量，所以并不能肯定高出多少，那么在测量时也就不能测得真实的硅含量。
本底补偿功能是通过用标准液对仪表进行的校准，因为理论上，校准时各点均应该在一条直线上，但是由于零点是倒加药，不受本底硅的影响，而其他各点均是正加药，受本底硅的影响。就造成了曲线的不线性，本底硅越高，则这种不线性越明显，根据不线性的程度，换算成一定的浓度值，再在测量时进行补偿，这就是硅酸根分析仪本底补偿功能的意义所在。
在线硅酸根分析仪硅酸根离子的分析方法
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